2005年，深圳划定了国内第一条城市生态保护控制线。客观而言，这条控制线划定后，对保障深圳基本生态安全、防止城市建设无序蔓延、实现生态城市建设目标等意义重大。然而在生态控制线划定前，许多工业区已经建成，被划入生态线后，一些基层社区的经济发展遭遇瓶颈，这在原特区外区域尤其突出。

自生态线划定之日起，关于基本生态控制线划定不尽合理的呼声不绝于耳。基层的诉求主要表现在两个方面：大量适合划入生态控制线的水域、山地、公园、道路等未划入控制线内；而不该划入的居民区、厂房等则被划入。基层街区对此意见很大，上访时有发生，基层矛盾突出。深圳相关部门亦多次调研，但一直未有明确说法，导致部分群众意见很大。

生态控制线此次局部优化调整，将部分平息基层的诉求和争议，其积极意义不容抹杀。需要警惕的是，这一项工作注定极具长期性和艰巨性，不仅因为所涉利益主体众多，更缘于深圳城市化转制过程中相关历史遗留问题的悬而未决。要处理好生态控制线问题，必须有配套的工作机制解决先期存在的违法建筑问题。毫不夸张地说，生态控制线与违建问题是一个连环套，属于你中有我，我中有你。

解决此类问题切忌头痛医头、脚痛医脚，而是需要对症下药，综合治理。深圳完成城市化转制后，集体土地全部收归国有，部分基层社区对补偿标准、非农用地指标落实等问题早有异议，原村民原本赖以生存的土地资源逐渐减少。如果一个基层社区部分被划入生态控制线，已建厂房不能参与市场经营，将进一步削弱其集体经济实力，如果已经形成的违法建筑没有出路，将强化原村民的恐慌心理。

鉴于深圳历史上每次出台治理违建的政策前后，均会出现“抢建潮”，这要求公共部门在制定政策时需要真正引入公众参与制度，制定政策需要脚踏实地地搞调查研究，了解实际情况，了解社情民意，处处体现公平、公开、公正。